A Copa do Brasil 2023 será disputada em mata-mata ao longo das suas sete fases. A Primeira Fase contará com 80 clubes e será definida em partida única. Em caso de empate, o melhor colocado no Ranking Nacional de Clubes avançará. A Segunda Fase com 40 clubes também será definida em duelo único. Em caso de empate, a decisão será nos pênaltis.

Todas as fases seguintes, por outro lado, serão com jogos de ida e volta. Em caso de empate na pontuação e no saldo de gols, a decisão será nos pênaltis. Não haverá "gol qualificado".

Na Terceira Fase, a Copa do Brasil receberá os participantes da Libertadores (Flamengo, Palmeiras, Internacional, Fluminense, Corinthians, Athletico Paranaense, Atlético Mineiro e Fortaleza), uma vaga pela classificação da Série A do Brasileiro (São Paulo - 9º colocado), o campeão da Copa do Nordeste (em 2023, a vaga ficou com o vice Sport, uma vez que o campeão Fortaleza pegou vaga por ter se classificado à Libertadores), o campeão da Copa Verde (Paysandu) e o campeão da Série B (Cruzeiro).

O campeão da Copa do Brasil terá vaga na fase de grupos da Libertadores. Em hipótese alguma o vice da Copa do Brasil ficará com a vaga da Libertadores. Se o campeão da Copa do Brasil conquistar a vaga através do Brasileirão, do título da própria Libertadores ou da Sul-americana, a vaga será repassada a um clube da Série A do Brasileiro.

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